nxtirfdata

doi：10.18129/b9.bioc.nxtirfdata

这是发展nxtirfdata的版本;对于稳定版本，请参阅nxtirfdata。

NXTIRF的数据

生物导体版本：开发（3.16）

NXTIRFDATA是NXTIRF的配套软件包，这是一个基于IRFinder的R软件包，用于内含子保留和RNA-Seq BAM文件的替代剪接定量。NXTIRFDATA包含生成人和鼠标参考所需的可视性文件。NXTIRFDATA还包含用于测试NXTIRF的综合基因组参考和示例BAM文件。BAM文件基于来自NCBI基因表达式Omnibus在登录号GSE67039下提供的6个样本。

作者：Alex Chit Hei Wong [AUT，CRE，CPH]，Ulf Schmitz [CTB]

维护者：Alex Chit Hei Wong

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ nxtirfdata”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ nxtirfdata”）

html	R脚本	NXTIRFDATA：NXTIRF的数据包
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	实验数据，，，，实验室，，，，表达数据，，，，基因组，，，，packagetypedata，，，，rnaseqdata
版本	1.3.0
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看
进口	实验室，，，，Biocfilecache，，，，rtracklayer，，，，r.utils
链接
建议	测试（> = 3.0.0），尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/alexchwong/nxtirfdata
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我	nxtirfcore
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nxtirfdata_1.3.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nxtirfdata
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nxtirfdata
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nxtirfdata/
软件包下载报告	下载统计