这是发展rtcga.methylation的版本;对于稳定版本,请参阅rtcga.methylation。
生物导体版本:开发(3.16)
软件包提供了来自http://gdac.broadinstitute.org/的所有可用队列类型的癌症基因组项目的甲基化(人甲基化27)数据集。数据格式在此处解释https://wiki.nci.nih.gov/display/tcga/dna+methylation数据来自2015-11-01快照。
作者:Marcin Kosinski [AUT,CRE],Witold Chodor [aut]
维护者:Marcin Kosinski
引用(从r内,输入引用(“ rtcga.methylation”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(sentern(version ='devel')biocmanager :: install(“ rtcga.methylation))”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rtcga.methylation”)
html | R脚本 | 使用RTCGA下载RTCGA.methylation中的甲基化数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,实验数据 |
版本 | 1.25.0 |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.3.0),RTCGA |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/rtcga/rtcga/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | RTCGA |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rtcga.methylation_1.25.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtcga.methylation |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rtcga.methylation |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rtcga.methylation/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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