RTCGA.rnaseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.rnaseq

这是发展RTCGA.rnaseq版本;稳定发布版本请参见RTCGA.rnaseq。

来自癌症基因组图谱计划的rna序列数据集

Bioconductor版本:开发(3.17)

Package提供来自Cancer Genome Atlas Project的所有队列类型的rna-seq数据集，来自http://gdac.broadinstitute.org/。这里解释了Rna-seq数据格式https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/RNASeq+Version+2。数据来源为illumina hiseq Level 3 RSEM规范化表达数据。数据来自2015-11-01快照。

作者:Marcin Kosinski

维护者:Marcin Kosinski

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.3")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #以下代码初始化BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("RTCGA.rnaseq")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“RTCGA.rnaseq”)

超文本标记语言	R脚本	使用RTCGA下载RTCGA. RNAseq中包含的RNAseq数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释数据，ExperimentData
版本	20151101.29.0
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.2.0)，RTCGA
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
这取决于我
进口我
建议我	RTCGA
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	RTCGA.rnaseq_20151101.29.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.rnaseq
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/RTCGA.rnaseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RTCGA.rnaseq/
软件包下载报告	下载数据