SCATEData

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCATEData

这是发展SCATEData版本;稳定发布版本请参见SCATEData。

SCATE(单细胞ATAC-seq信号提取和增强)数据

Bioconductor版本:开发(3.17)

SCATE是一个用于提取和增强稀疏和离散单细胞ATAC-seq信号的软件工具。

作者:季志成[aut]，周卫强[aut]，侯文品[re, aut]，季鸿恺[au]

维护者:侯文品

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.3")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化biocdevel的使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SCATEData")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“SCATEData”)

超文本标记语言	R脚本	1.SCATEData包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub
版本	1.9.0
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)，ExperimentHub，GenomicAlignments，GenomicRanges、基础
进口	跑龙套
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Winnie09/SCATEData/issues
这取决于我	SCATE
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	SCATEData_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/SCATEData
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/SCATEData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SCATEData/
软件包下载报告	下载数据