这是发展TENxBUSData版本;稳定版请参见TENxBUSData.
Bioconductor版本:开发(3.16)
从R中下载10倍数据集的Barcode, UMI, and Set (BUS)格式。该包附带BUSpaRse包,它可以将BUS格式作为稀疏矩阵加载到R中,并且具有与使用c++命令行包bustools相关的实用函数。
维护:Lambda Moses
引文(从R内,输入引用(“TENxBUSData”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("TENxBUSData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“TENxBUSData”)
超文本标记语言 | R脚本 | 下载总线数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,SequencingData,SingleCellData |
版本 | 1.11.0 |
许可证 | BSD_2_clause +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | ExperimentHub,AnnotationHub跑龙套,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/BUStools/TENxBUSData |
BugReports | https://github.com/BUStools/TENxBUSData/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | BUSpaRse |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TENxBUSData_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TENxBUSData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TENxBUSData |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/TENxBUSData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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