WGSmapp

DOI:10.18129 / B9.bioc.WGSmapp

这是发展WGSmapp版本;稳定版请参见WGSmapp．

ENCODE项目全基因组测序的可映射性轨迹

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包提供了人类hg19/hg38组装的全基因组可映射性跟踪。我们使用了ENCODE项目中的100-mers可映射性跟踪，如果多个ENCODE区域与同一bin重叠，则计算可映射性得分的加权平均。“黑名单”箱，包括从端粒、着丝粒和/或异染色质区域的片段重复区域和参考组装中的间隙。该数据集由三个组装的。bam文件组成，用于演示10X的单细胞全基因组测序。

作者:王如金

维护者:Rujin Wang < Rujin at emem.unc.edu >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("WGSmapp")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNASeqData，编码，ExperimentData，基因组，Homo_sapiens_Data，SequencingData，SingleCellData
版本	1.11.0
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6.0)，GenomicRanges
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	范围
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	WGSmapp_1.11.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/WGSmapp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/WGSmapp
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/WGSmapp/
软件包下载报告	下载数据