brgedata

DOI:10.18129 / B9.bioc.brgedata

这是发展brgedata的版本;稳定版请参见brgedata

用于说明目的的暴露、基因表达和甲基化数据

Bioconductor版本:开发(3.16)

该软件包包含几组组学数据,包括基因表达(ExpressionSet)、甲基化(GenomicRatioSet)、蛋白质组和暴露体(ExposomeSet)。这些数据用于MEAL、MultiDataSet和omicRexposome的插图和示例。

作者:Dolors Pelegri-Siso [aut, cre], Carlos Ruiz-Arenas [aut], Carles Hernandez-Ferrer [aut], Juan R. Gonzalez [aut]

维持器:Dolors Pelegri-Siso < Dolors。Pelegri在isglobal.org>

引文(从R内,输入引用(“brgedata”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("brgedata")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“brgedata”)

超文本标记语言 R脚本 brgedata——数据R包,包含三个omic数据集和来自同一个西班牙语的暴露数据集
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataHomo_sapiens_DataMethylationArrayDataMicroarrayData
版本 1.19.0
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.5.0),Biobase
进口 SummarizedExperiment
链接
建议 minfiMultiAssayExperimentknitrrmarkdownrexposome
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 MultiDataSetomicRexposome
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 brgedata_1.19.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/brgedata
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/brgedata
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/brgedata/
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