这是发展curatedAdipoRNA版本;稳定发布版本请参见curatedAdipoRNA.
Bioconductor版本:开发(3.17)
RNA-Seq样本的策划数据集。样本是mdi诱导的不同时间点/分化阶段的前吞噬细胞(3T3-L1)。对包文件进行数据采集、预处理和处理。除了文档之外,包还包含用于生成数据的脚本。
维护者:Mahmoud Ahmed < Mahmoud .s。法赫米看着学生们
引用(从R中,输入引用(“curatedAdipoRNA”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("curatedAdipoRNA")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“curatedAdipoRNA”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用curatedAdipoRNA |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,地理,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.15.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6),SummarizedExperiment |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,DESeq2,fastqcr,devtools,testthat,readr,dplyr,tidyr,ggplot2,S4Vectors |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/MahShaaban/curatedAdipoRNA |
BugReports | https://github.com/MahShaaban/curatedAdipoRNA/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | curatedAdipoRNA_1.15.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/curatedAdipoRNA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/curatedAdipoRNA |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/curatedAdipoRNA/ |
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