多萝西娅

DOI:10.18129 / B9.bioc.dorothea

这是发展多萝西娅版本;稳定发布版本请参见多萝西娅．

收集人类和老鼠的TF规则

Bioconductor版本:开发(3.16)

DoRothEA是一个基因调控网络，它包含了标记转录因子(TF)和靶基因的相互作用。TF及其转录靶标的收集是由不同类型的证据策划和收集的，适用于人类和小鼠。根据支持证据的数量，为每一个TF-target相互作用分配一个置信水平。

作者:丹尼尔·迪米特洛夫， Christian H. Holland [au]， Luz Garcia-Alonso [aut]， Alberto Valdeolivas [ctb]， Minoo Ashtiani [ctb]， Attila Gabor [ctb]

维护者:丹尼尔·迪米特洛夫<丹尼尔。迪米特洛夫在海德堡大学>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化Bioc devel BiocManager的用法::install(version='devel') BiocManager::install("dorothea")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“多萝西娅”)

超文本标记语言	R脚本	多萝西娅调节子。
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData，Homo_sapiens_Data，Mus_musculus_Data
版本	1.9.0
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)
进口	dplyr，magrittr，bcellViper，毒蛇
链接
建议	Biobase，BiocStyle，knitr，pheatmap，pkgdown，rmarkdown，修拉，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，testthat(> =魅惑,宠物猫，tidyr,跑龙套
SystemRequirements
增强了
URL	https://saezlab.github.io/dorothea/https://github.com/saezlab/dorothea
BugReports	https://github.com/saezlab/dorothea/issues
全靠我
进口我	cosmosR，更容易
建议我	MethReg
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	dorothea_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dorothea
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/dorothea/
软件包下载报告	下载数据