furrowSeg

DOI:10.18129 / B9.bioc.furrowSeg

这是发展furrowSeg版本;稳定发布版本请参见furrowSeg

沟分割

Bioconductor版本:开发(3.16)

Guglielmi, Barry等人论文的图像特征数据和分析代码,描述了光遗传学工具的应用,以破坏果蝇胚胎的沟槽。

作者:约瑟夫·巴里

维护者:Joseph Barry < Joseph。巴里在embl.de >

引用(从R中,输入引用(“furrowSeg”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("furrowSeg")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“furrowSeg”)

PDF R脚本 补充方法-自动生成纸质图形
PDF R脚本 补充方法-犁沟分割示例
PDF 参考手册

细节

biocViews Drosophila_melanogaster_DataExperimentDataReproducibleResearch组织
版本 1.25.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3),EBImage
进口 abinddplyrlocfittiff
链接
建议 BiocStyleggplot2knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 furrowSeg_1.25.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/furrowSeg
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ furrowSeg
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/furrowSeg/
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