gageData

DOI:10.18129 / B9.bioc.gageData

这是发展gageData的版本;稳定发布版本请参见gageData

仪表包的辅助数据

Bioconductor版本:开发(3.17)

这是一个支持软件包的软件包,压力表。然而,这里提供的数据对基因集或途径分析或微阵列数据分析也很有用。在这个包中,我们提供了两个演示微阵列数据集:GSE16873(来自GEO的乳腺癌数据集)和BMP6(最初作为GAGE的演示数据集发布,也在GEO注册为GSE13604)。该软件包还包括基于KEGG途径和GO术语的常用基因集数据,用于主要研究物种,包括人类,小鼠,大鼠和芽殖酵母。还包括出芽酵母的常见基因id之间的映射数据。

作者:罗伟军

维护者:罗伟军<罗伟军@ yahoo.com>

引用(来自R,输入引用(“gageData”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.3")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化biocdevel的使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("gageData")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

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细节

biocViews BreastCancerDataCancerDataExperimentData地理MicroarrayData干细胞的
版本 2.37.0
许可证 GPL (> = 2.0)
取决于 R (>= 2.10)
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建议 pathviewgenefilter
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包档案

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源包 gageData_2.37.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/gageData
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gageData
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/gageData/
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