mosaicsExample

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaicsExample

这是发展mosaicsExample版本;稳定的发布版本,请参阅mosaicsExample。

马赛克包示例数据,实现了马赛克,MOSAiCS-HMM统计框架来分析一个样品或两个示例ChIP-seq转录因子的数据绑定和组蛋白修饰

Bioconductor版本:发展(3.17)

数据拼接方案,包括(1)染色体22芯片和控制从STAT1 ChIP-seq实验样本数据绑定和H3K4me3 MCF7细胞行编码数据库中修改(HG19)和(2)21号染色体芯片和控制从STAT1 ChIP-seq实验样本数据绑定,mappability, GC含量,和人类基因组HG18序列模糊评分。

作者:东峻涌裴分矿,Rene韦尔奇,Sunduz凯尔

维护人员:东峻涌<东峻。钟在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“mosaicsExample”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseqData,ExperimentData,Homo_sapiens
版本	1.37.0
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.11.1)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
取决于我
进口我
建议我	马赛克
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	mosaicsExample_1.37.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaicsExample
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mosaicsExample
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mosaicsExample/
包下载报告	下载数据