pasillaBamSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.pasillaBamSubset

这是发展pasillabam子集的版本;稳定发布版本请参见pasillaBamSubset．

来自“Pasilla”实验的BAM文件的子集

Bioconductor版本:开发(3.16)

未处理的BAM文件的子集。砰(单端读取)和未处理3。bam(配对端读取)来自“Pasilla”实验(Pasilla被Brooks等人击倒，基因组研究2011年)。参见pasilla数据包中的小插图，了解BAM文件如何未处理1。砰，不治之症。bam从NCBI Gene Expression Omnibus提供的RNA-Seq读取序列数据中获得，登录号为GSM461176至GSM461181。也包含了苍蝇染色体4的DNA序列，读取可以映射到。

作者:Hervé Pagès

维护器:Hervé Pagès

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" pasillabam子集")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DNASeqData，ExperimentData，基因组，RNASeqData
版本	0.35.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	APAlyzer，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicRanges，gmoviz，IRanges，karyoploteR，plyranges，TransView
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pasillaBamSubset_0.35.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/pasillaBamSubset
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ pasillabam子集
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pasillaBamSubset/
软件包下载报告	下载数据