rcellminerdata

doi:10.18129/b9.bioc.rcellminerdata

这是发展rcellminerdata的版本;对于稳定版本,请参阅rcellminerdata

rcellminerdata:NCI-60细胞系的分子曲线和药物反应

生物导体版本:开发(3.16)

NCI-60癌细胞系面板已在数十年中用作抗癌药物筛查。该小组是美国国家癌症研究所(NCI)的开发治疗计划(DTP,http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分。已经在NCI-60上测试了数千种化合物,这些化合物的特征是许多用于基因和蛋白质表达,拷贝数,突变等的平台(Reinhold等,2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)的目的是整合来自用于分析NCI-60的多个平台的数据,并为NCI-60的探索提供了强大的工具数据。

作者:Augustin Luna,Vinodh Rajapakse,Fabricio Sousa

维护人员:Augustin Luna ,vinodh rajapakse ,fathi elloumi >

引用(从r内,输入引用(“ rcellminerdata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = deS ='devel')biocmanager :: install(“ rcellminerdata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rcellminerdata”)

html R脚本 访问CellMiner数据
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 癌症,,,,coplenumbervariationdata,,,,实验数据,,,,表达数据,,,,微阵列,,,,NCI,,,,SNPDATA,,,,米尔纳达塔
版本 2.19.0
执照 LGPL-3 +文件执照
要看 r(> = 3.5.0),生物酶
进口
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,生物使用,,,,rcellminer,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我 rcellminer
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rcellminerdata_2.19.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminerdata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcellminerdata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rcellminerdata/
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