scpdata

doi:10.18129/b9.bioc.scpdata

这是发展SCPDATA的版本;对于稳定版本,请参阅scpdata

单细胞蛋白质组学数据包

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包分发了质谱(MS)的单细胞蛋白质组学(SCP)数据集。数据是从已发布的工作中收集的,并使用``scp'数据结构''进行了格式化。数据集包含单细胞或微小样品量的光谱,肽和/或蛋白质水平的定量信息。

作者:Christophe Vanderaa [AUT,CRE],Laurent Gatto [AUT]

维护者:christophe vanderaa

引用(从r内,输入引用(“ scpdata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ scpdata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ scpdata”)

html R脚本 单细胞蛋白质组学的数据包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,群众光谱,,,,蛋白质组,,,,reproducibleresearch,,,,Singlecelldata
版本 1.5.0
执照 GPL-2
要看 r(> = 4.1),qfeatures,,,,实验室
进口 utils,AnnotationHub,,,,Singlecellexperiment,,,,S4VECTORS
链接
建议 SCP,,,,马格里特,,,,dplyr,,,,尼特,,,,生物使用,,,,生物检查,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scpdata_1.5.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scpdata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scpdata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/scpdata/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户