art

doi:10.18129/b9.bioc.tartare

这是发展art的版本;对于稳定版本,请参阅art

在热渔民科学质谱仪上记录的原始光谱

生物导体版本:开发(3.16)

提供记录在不同液相色谱质谱(LC-MS)仪器上的原始文件。所有包括MS仪器均由Thermo Fisher Scientific制造,属于Orbitrap Tribrid或Q Exprive Orbitrap仪器家族。尽管它们具有共同的起源和共享硬件组件,例如Orbitrap Mass Analyzer,但上述仪器倾向于以共享的二进制文件格式(.raw)以不同的“方言”编写数据。Tartare背后的目的是提供复杂但苗条的现实文件,这些文件可用于使代码在这种多样性方面可靠。换句话说,它旨在增强单位测试。该软件包被认为与RAWRR软件包和Spectra msbackends一起使用。

作者:克里斯蒂安·潘斯[AUT,CRE],Tobias Kockmann [aut]

维护者:Christian Panse

引用(从r内,输入引用(“ tartare”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ tartare”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ art”)

html R脚本 制作和使用art数据
PDF 参考手册

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,群众光谱
版本 1.11.0
执照 GPL-3
要看 r(> = 4.1),AnnotationHub(> = 2.16),实验室(> = 1.0)
进口 UTILS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试, 工具
系统要求
增强
URL https://github.com/cpanse/tartare
BugReports https://github.com/cpanse/tartare/issues
取决于我
进口我
建议我 MSBACKENDRAWFILEREREDER,,,,RAWRR
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tartare_1.11.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tartare
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/art
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tartare/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户