这是发展art的版本;对于稳定版本,请参阅art。
生物导体版本:开发(3.16)
提供记录在不同液相色谱质谱(LC-MS)仪器上的原始文件。所有包括MS仪器均由Thermo Fisher Scientific制造,属于Orbitrap Tribrid或Q Exprive Orbitrap仪器家族。尽管它们具有共同的起源和共享硬件组件,例如Orbitrap Mass Analyzer,但上述仪器倾向于以共享的二进制文件格式(.raw)以不同的“方言”编写数据。Tartare背后的目的是提供复杂但苗条的现实文件,这些文件可用于使代码在这种多样性方面可靠。换句话说,它旨在增强单位测试。该软件包被认为与RAWRR软件包和Spectra msbackends一起使用。
作者:克里斯蒂安·潘斯[AUT,CRE],Tobias Kockmann [aut]
维护者:Christian Panse
引用(从r内,输入引用(“ tartare”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ tartare”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ art”)
html | R脚本 | 制作和使用art数据 |
参考手册 |
生物浏览 | 实验数据,,,,实验室,,,,群众光谱 |
版本 | 1.11.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 4.1),AnnotationHub(> = 2.16),实验室(> = 1.0) |
进口 | UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试, 工具 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/cpanse/tartare |
BugReports | https://github.com/cpanse/tartare/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | MSBACKENDRAWFILEREREDER,,,,RAWRR |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tartare_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tartare |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/art |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/tartare/ |
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