timecoursedata

DOI:10.18129 / B9.bioc.timecoursedata

这是发展timecoursedata版本;稳定发布版本请参见timecoursedata

一个用于时间过程RNA-seq和微阵列基因表达数据集的数据包

Bioconductor版本:开发(3.16)

此数据包包含时间过程基因表达数据集。第一个数据集来自Shoemaker等人,由来自14个时间点暴露于不同流感毒株的小鼠肺组织的微阵列样本组成。另外两个数据集是高粱作物在开花前和开花后的干旱胁迫和对照条件下的叶片和根系样本,样本贯穿植物的生命周期。

作者:Elizabeth Purdom,奈尔·瓦洛夸[法语]

维护者:Nelle Varoquaux < Nelle。在gmail.com varoquaux >

引用(从R中,输入引用(“timecoursedata”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("timecoursedata")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“timecoursedata”)

超文本标记语言 R脚本 timecoursedata:时间过程基因表达数据集
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews ExperimentDataExpressionDataMicroarrayDataRNASeqData
版本 1.7.0
许可证 BSD 3-clause许可+文件许可证
取决于 R (> = 4.0),SummarizedExperiment
进口
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建议 testthat(> = 1.0.0),knitrrmarkdown减价covrBiocStyle
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 timecoursedata_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timecoursedata
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ timecoursedata
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/timecoursedata/
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