tximportData

DOI:10.18129 / B9.bioc.tximportData

这是发展tximportData版本;稳定的发布版本,请参阅tximportData。

tximportData

Bioconductor版本:发展(3.16)

这个包提供了运行的输出各种记录丰富的量词在一组6 RNA-seq样本GEUVADIS项目。量词是袖扣,RSEM kallisto,鲑鱼和旗鱼。小鲑鱼示例输出也包括在内。Forr细节版本号、样品信息,详情电话,看到包的装饰图案。

作者:迈克尔的爱

维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“tximportData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tximportData”)

HTML	R脚本	为tximport示例输出文件
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,RNASeqData,SequencingData
版本	1.25.0
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口
链接
建议	knitr,减价
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	DESeq2,eds,鱼池,HumanTranscriptomeCompendium,tximeta,tximport,variancePartition
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	tximportData_1.25.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tximportData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/tximportData/
包下载报告	下载数据