### r代码来自Vignette Source'Beadarrayexampledata.rnw'########################################################### ###代码块编号1：Beadarrayexampledata.rnw：30-31 ###########################################################################################-50 #############################图书馆（Beadarrayexampledata）数据（examplebldata）examplebldata数据（示例ummarydata）示例ummarydata pdata（示例ummarmarydata）#################################################################################）## ## targets < - read.table（system.file（“ extdata/extdata/beadlevelbabfiles/targetsht12.txt”，package =“ beadarrayusecases”），header = true，sep =“ \ t”，as.is as.is = true）## sn < - 粘贴（targets [，3]，targets [，4]，sep =“ _”）## ## ## babfilepath <-system.file（“ extdata/beadlevelbabfiles）“，package =“ beadarrayusecases”）## ##示例bldata <-- readillumina（dir = babfilepath，sectionNames = sn [c（1,12）]，useimages = false，false，illuminaAnnotation =“ humanv3”）## ## ## ## ## bsh bsh < -bash（examplebldata，array = c（1,2））## ## examplebldata <- setWeights（exampleBldata，wts = bsh $ wts，array = 1：2）## ## data <-eReadillumina（dir = babfilepath，sectionnames，sectionnames，sectionNames= sn，useimages = false，iLluminaAnnotation =“ humanv3”）## ## ## grnChannel <-- new（“ iLluminachannel”，transfun = loggreenchanneltransform，oflierfun = iLLUMINAOUTLIERFUN，EXPRFUN，EXPRFUN，EXPRFUN =功能（x，x，x，x，x，x，na.rm = x）（x，x，x，na.rm = x）true），varfun = function（x）sd（x，na.rm = true），channelname =“ g”）## ## ## ## grnchannel.unlogged <-- new（“ iLLUMINACHANNEL”，TRANSFUN = GREENCHANNELELTRANSFORM，OUTLIERFUN = ILLUMINAOUTLIERFUN = ILLUMINAOUTLIERMETHODLIERMETHODOD，exprfun = function（x）均值（x，na.rm = true），varfun = function（x）sd（x，na.rm = true），channelname =“ g.ul”）## ## ##示例ummarmarydata <--总结（数据，列表（grnChannel，grnchannel.unlogged），useplamefac = false）## ## ## ## pdata（示例ummarydata）[，2] < - targets [，2] ## ## ## ## ## ## ## ## ## ##