GEOMXWORKFLOWS

doi：10.18129/b9.bioc.geomxworkflows

这是发展GEOMXWORKFLOWS的版本；对于稳定版本，请参阅GEOMXWORKFLOWS。

GEOMX数字空间分析师（DSP）数据分析工作流程

生物导体版本：开发（3.16）

与纳米弦技术一起使用的工作流Geomx技术。软件包提供了以生物为中心的工作流程来利用现有软件包（例如Geomxtools）处理，QC和分析数据。

作者：Jason Reeves [Cre，Aut]，Prajan Divakar [AUT]，Nicole Ortogero [AUT]，Maddy Griswold [Aut]，Zhi Yang [Aut]，Stephanie Zimmerman [Aut]这是给予的

维护者：Jason Reeves

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ GEOMXWORKFLOWS”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ GeomXworkFlows”）

html	R脚本	用Geomxtools分析GEOMX-NGS数据
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	geneexpressionworkflow，，，，Immunooncologyworkflow，，，，空间工作流，，，，工作流程
版本	1.3.0
执照	麻省理工学院
要看	r（> = 4.0），纳米林区，，，，Geomxtools
进口	生物酶，，，，S4VECTORS，，，，rjson，，，，readxl，，，，环境，，，，dplyr，，，，RESHAPE2，方法，utils，stats，Data.Table，，，，异常值，，，，生物基因，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，GGFORCE，，，，牛仔图，，，，秤，，，，UMAP，，，，RTSNE，，，，pheatmap，，，，生物使用
链接
建议	rmarkDown，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	geomxworkflows_1.3.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geomxworkflows
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/geomxworkflows
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/geomxworkflows/
软件包下载报告	下载统计