rnaseqdtu

doi：10.18129/b9.bioc.rnaseqdtu

这是发展RNASEQDTU的版本;对于稳定版本，请参阅rnaseqdtu。

鲑鱼定量后，用于差分转录本的RNA-SEQ工作流程

生物导体版本：开发（3.16）

鲑鱼定量后，用于差分转录用法（DTU）的RNA-SEQ工作流。该工作流使用bioconductor套件TXIMPORT，DRIMSEQ和DEXSEQ对模拟数据进行DTU分析。它还显示了如何使用Stager进行DTU的两阶段测试，DTU是一个在基因水平上筛选的统计框架，然后确认重要基因中的哪些转录本显示了DTU的证据。

作者：Michael Love [Aut，Cre]，Charlotte Soneson [aut]，Rob Patro [aut]

维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rnaseqdtu”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rnaseqdtu”）

html

R脚本

鲑鱼定量后，用于差分转录本的RNA-SEQ工作流程

细节

生物浏览	geneexpressionworkflow，，，，Immunooncologyworkflow，，，，工作流程
版本	1.17.0
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5.0），Drimseq，，，，dexseq，，，，斯塔格，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，拉法里布，，，，DevTools
进口
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/mikelove/rnaseqdtu/
取决于我
进口我
建议我
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rnaseqdtu_1.17.0.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqdtu
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rnaseqdtu
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rnaseqdtu/
软件包下载报告	下载统计