逃避

DOI:10.18129 / B9.bioc.escape

简单的单细胞富集分析平台

Bioconductor版本:发行版(3.16)

一种桥接R包，以促进单细胞RNA测序背景下的基因集富集分析(GSEA)。使用原始计数信息、Seurat对象或singlecel实验格式，用户可以跨单个单元执行和可视化GSEA。

作者:Nick Borcherding [aut, cre]， Jared Andrews [aut]

维护者:Nick Borcherding

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“逃离”)

超文本标记语言	R脚本	Escape-ingToWork
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，分类，GeneSetEnrichment，GeneSignaling，通路，测序，SingleCell，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.1)
进口	grDevices,dplyr，ggplot2，GSEABase，GSVA，SingleCellExperiment，ggridges，msigdbr统计数据,BiocParallel，矩阵，UCell，扫帚，reshape2，拼接而成，MatrixGenerics跑龙套,rlang，stringr，data.table，SummarizedExperiment、方法
链接
建议	修拉，SeuratObject，knitr，rmarkdown，减价，BiocStyle，testthat，dittoSeq(> = 1.1.2)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	Cepo
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	escape_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	escape_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	escape_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/escape
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/escape/
软件包下载报告	下载数据