excluderanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.excluderanges

有问题的基因组区域的基因组坐标

Bioconductor版本:发行版(3.16)

在处理基因组数据时应避免的有问题的基因组区域的基因组坐标。排除区域(以前称为黑名单)，着丝粒，端粒，已知异染色质区域等(UCSC“间隙”表数据)。主要用于人类和小鼠基因组，hg19/hg38和mm9/mm10基因组组装。

作者:米哈伊尔·多兹莫洛夫[aut, cre]， Eric Davis [aut]， Wancen Mu [aut]， Stuart Lee [aut]， Tim Triche [aut]， Douglas Phanstiel [aut]， Michael Love [aut]

维护者:Mikhail Dozmorov < Mikhail。多兹莫洛夫在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“excluderanges”)

超文本标记语言	R脚本	excluderanges
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，FunctionalAnnotation，GenomicSequence
版本	0.99.8
许可证	MIT +文件许可证
取决于	GenomicRanges
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，RefManageR，rmarkdown，ggridges，httr，readr，pheatmap，rtracklayer，AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/dozmorovlab/excluderanges
BugReports	https://github.com/dozmorovlab/excluderanges/issues
全靠我
进口我
建议我	nullranges
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	excluderanges_0.99.8.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/excluderanges/
软件包下载报告	下载数据