fobitools

DOI:10.18129 / B9.bioc.fobitools

操作FOBI本体的工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

一套与食品生物标记本体(FOBI)交互的工具。一组用于生物意义分析、图表和注释营养数据的文本挖掘策略的基本操作工具。

作者:Pol Castellano-Escuder [aut, cre],克里斯蒂娜Andrés-Lacueva [aut], Alex Sánchez-Pla [aut]

维护者:Pol Castellano-Escuder

引文(从R内,输入引用(“fobitools”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“fobitools”)

超文本标记语言 R脚本 膳食文本注释
超文本标记语言 R脚本 简单的食物ORA
超文本标记语言 R脚本 用例ST000291
超文本标记语言 R脚本 用例ST000629
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释BiomedicalInformaticsCheminformaticsGeneSetEnrichmentGraphAndNetworkMassSpectrometry代谢组学通路软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.1)
进口 clisymbols蜡笔dplyrfgseaggplot2ggraphmagrittrontologyIndexpurrrRecordLinkagestringrtextclean发出滴答声tidygraphtidyr发呜呜声
链接
建议 BiocStylecovrggrepelkableExtraknitrmetabolomicsWorkbenchRPOMArmarkdown房车SummarizedExperimenttestthat2.3.2 (> =)tidyverse
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/
BugReports https://github.com/pcastellanoescuder/fobitools/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 fobitools_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 fobitools_1.6.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) fobitools_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) fobitools_1.6.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fobitools
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ fobittools
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/fobitools/
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