Bioconductor版本:版本(3.17)
专用增强方法实现flowSet, ncdfFlowSet和GatingSet类,生和封闭的流式细胞仪数据可以直接与ggplot绘制。ggcyto包装和一些习惯了层还可以很容易地添加盖茨和人口统计的阴谋。
作者:迈克江
维护人员:迈克江迈克< ozette.com >
从内部引用(R,回车引用(“ggcyto”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggcyto”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ggcyto”)
HTML | R脚本 | 特性的总结ggcyto |
HTML | R脚本 | 血细胞计数数据的快速绘制 |
HTML | R脚本 | 可视化与ggcyto flowSet |
HTML | R脚本 | 可视化与ggcyto GatingSet |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | CellBasedAssays,FlowCytometry,ImmunoOncology,基础设施,软件,可视化 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(7年) |
许可证 | 文件许可证 |
取决于 | 方法,ggplot2 (> = 3.3.0),flowCore(> = 1.41.5),ncdfFlow(> = 2.17.1),flowWorkspace(> = 3.33.1) |
进口 | plyr、音阶、hexbin数据。表、RColorBrewer gridExtra rlang |
链接 | |
建议 | testthat,flowWorkspaceDataknitr rmarkdown,flowStats,openCyto,flowViz、ggridges vdiffr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RGLab/ggcyto/issues |
取决于我 | flowGate |
进口我 | CytoML,CytoPipeline |
建议我 | 催化剂,flowCore,flowStats,flowTime,flowWorkspace,openCyto |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ggcyto_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | ggcyto_1.28.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | ggcyto_1.28.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | ggcyto_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggcyto |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ggcyto/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ggcyto/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor