ggtreeExtra

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggtreeExtra

在圆形或其他布局树“ggtree”上添加几何图层的R包

Bioconductor版本:发行版(3.15)

'ggtreeExtra'扩展了使用'ggtree'在系统发育树上映射和可视化相关数据的方法。这些相关数据可以显示在外部面板上，用于圆形布局、扇形布局或其他由'ggtree'使用'ggplot2'语法构建的矩形布局树。

作者:徐双斌[aut, cre]，余光创[aut, ctb]

维护人员:徐双斌< x双斌at 163.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ggtreeExtra”)

超文本标记语言	R脚本	ggtreeExtra
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，系统发生学，软件，可视化
版本	1.6.1
在Bioconductor公司	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于
进口	ggplot2跑龙套,rlang，ggnewscale统计数据,ggtree，tidytree(> = 0.3.9)
链接
建议	treeio，ggstar，拼接而成，knitr，rmarkdown，prettydoc，减价，testthat(> = 3.0.0),支柱
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/
BugReports	https://github.com/YuLab-SMU/ggtreeExtra/issues
全靠我
进口我	MicrobiotaProcess
建议我	enrichplot，ggmsa
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ggtreeExtra_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	ggtreeExtra_1.6.1.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ggtreeExtra_1.6.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ggtreeExtra
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ggtreeExtra
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ggtreeExtra/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档