gwasurvivr

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwasurvivr

gwasurvivr: R包基因组广泛的生存分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

gwasurvivr包进行生存分析使用Cox比例风险模型估算遗传数据。

作者:阿巴斯Rizvi, Ezgi Karaesmen马丁·摩根,劳拉Sucheston-Campbell

维护人员:阿巴斯Rizvi < aarizv gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gwasurvivr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gwasurvivr”)

HTML	R脚本	gwasurvivr装饰图案
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,GeneticVariability,遗传学,GenomeWideAssociation,药物基因组学,回归,单核苷酸多态性,软件,生存
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	GWASTools生存,VariantAnnotation、平行、matrixStatsSummarizedExperiment,统计,跑龙套,SNPRelate
链接
建议	BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/suchestoncampbelllab/gwasurvivr
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	gwasurvivr_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	gwasurvivr_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	gwasurvivr_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	gwasurvivr_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwasurvivr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gwasurvivr
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gwasurvivr/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gwasurvivr/
包下载报告	下载数据