Bioconductor版本:发行版(3.16)
一种函数,它读入基因表达数据集的GEO登录代码,从GEO检索其数据,并检查数据集中是否存在健康对照的数据。如果找到健康的控件数据,则返回true,否则返回false。基因表达综合。ID:标识码。GEO数据集从URL下载
维护者:Davide Chicco < Davide。Chicco在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“healthyControlsPresenceChecker”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“healthyControlsPresenceChecker”)
超文本标记语言 | R脚本 | healthyControlsPresenceChecker装饰图案 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,ExpressionData,地理,RepositoryData |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.0.0) |
进口 | xml2,GEOquery,geneExpressionFromGEO,magrittr |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,减价,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker |
BugReports | https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | healthyControlsPresenceChecker_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/healthyControlsPresenceChecker |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/healthyControlsPresenceChecker |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/healthyControlsPresenceChecker/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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