isomiRs

DOI:10.18129 / B9.bioc.isomiRs

分析小RNA-seq中的异构体和mirna

Bioconductor版本:发行版(3.16)

mirna和异构体的特征、聚类和差异表达。

作者:Lorena Pantano [aut, cre]， Georgia Escaramis [aut] (CIBERESP - CIBER流行病学和Salud Publica)

维护者:Lorena Pantano < Lorena。Pantano在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“isomiRs”)

超文本标记语言	R脚本	miRNA和异构体分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，ImmunoOncology，RNASeq，软件，microrna的
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)，SummarizedExperiment
进口	AnnotationDbi，assertive.sets，BiocGenerics，Biobase，扫帚，集群，cowplot，DEGreport，DESeq2，IRanges，dplyr，GenomicRanges，gplots，ggplot2，gtools，gridExtra，网格，grDevices，图形，GGally，limma、方法、RColorBrewer，readr，重塑，rlang统计数据,stringr，S4Vectors，tidyr，宠物猫
链接
建议	knitr，rmarkdown，org.Mm.eg.db，targetscan.Hs.eg.db，pheatmap，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/lpantano/isomiRs/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	isomiRs_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	isomiRs_1.26.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	isomiRs_1.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	isomiRs_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isomiRs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/isomiRs
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/isomiRs/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/isomiRs/
软件包下载报告	下载数据