mbOmic

DOI:10.18129 / B9.bioc.mbOmic

微生物组和代谢组的综合分析

Bioconductor版本:发行版(3.15)

mbOmic包包含一组微生物学和代谢组学数据的分析功能，旨在分析微生物学和代谢产物之间的组间相关性。微生物组和代谢组的综合分析是mbOmic的目标。初步实现了利用肠道菌群丰度进行肠型鉴定。

作者:巩聪聪[aut, cre]

维护人员:congconggong

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mbOmic")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“mbOmic”)

超文本标记语言	R脚本	enterotyping
超文本标记语言	R脚本	代谢组与微生物组的综合分析
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文本		新闻

细节

biocViews	代谢组学,微生物组,网络,软件
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	平行,doParallel,心理,WGCNA,data.table,igraph,visNetwork,集群,clusterSim，方法，图形，统计
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,devtools,嫁祸于
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/gongcongcong/mbOmic
BugReports	https://github.com/gongcongcong/mbOmic/issues
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	mbOmic_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	mbOmic_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	mbOmic_1.0.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/mbOmic
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mbOmic
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mbOmic/
软件包下载报告	下载数据