metavizr

DOI:10.18129 / B9.bioc.metavizr

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

R metaviz web应用程序接口交互的宏基因组数据分析和可视化

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包提供了Websocket沟通metaviz web应用程序(http://metaviz.cbcb.umd.edu)的宏基因组数据的交互式可视化。R / bioc交互式会话中的对象可以显示在情节和数据可以探索使用facetzoom可视化。支持基本Bioconductor数据结构(例如,MRexperiment对象),同时提供一个简单的机制来支持其他数据结构。可视化(使用d3.js)可以很容易地添加到web应用程序。

作者:赫克托耳Corrada布拉沃(cre, aut)弗罗林Chelaru (aut),贾斯汀·瓦格纳(aut) Jayaram Kancherla (aut),约瑟夫·保尔森(aut)

维修工:赫克托耳Corrada布拉沃< hcorrada gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“metavizr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	GUI,ImmunoOncology,基础设施,宏基因组,软件,可视化
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.4),metagenomeSeq(> = 1.17.1)方法、data.tableBiobase,消化
进口	epivizr,epivizrData,epivizrServer,epivizrStandalone素食主义者,GenomeInfoDb,phyloseq,httr
链接
建议	knitr,BiocStylematrixStats,msd16s(> = 0.109.1),etec16stestthat gss,ExperimentHub、tidyr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metavizr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metavizr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/metavizr/
包下载报告	下载数据