miaViz

DOI:10.18129 / B9.bioc.miaViz

微生物组分析绘图与可视化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

miaViz包实现了绘图功能，在微生物组分析上下文中使用treesummarizeexperiment和相关对象。其中包括绘制树，图表和微生物组系列数据。该方案是更广泛的miaverse框架的一部分。

作者:Felix G.M. Ernst [aut]，托马斯·博尔曼[aut, cre]，利奥·拉赫蒂[au]

维护人员:Tuomas Borman < Tuomas .v.;Borman在utu.fi>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miaViz”)

超文本标记语言	R脚本	miaViz
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	微生物组，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	artist -2.0 |文件许可证
取决于	R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，TreeSummarizedExperiment，米娅(> = 0.99),ggplot2，ggraph(> = 2.0)
进口	方法、统计数据S4Vectors，BiocGenerics，BiocParallel，DelayedArray，嘘，ggtree，ggnewscale，冬青，宠物猫，tidytree，tidygraph，rlang，purrr，tidyr，dplyr，猿，DirichletMultinomial
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，拼接而成，microbiomeDataSets
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	miaViz_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	miaViz_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	miaViz_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	miaViz_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaViz
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miaViz
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miaViz/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miaViz/
软件包下载报告	下载数据