mosbi

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosbi

利用聚类技术进行分子特征识别

Bioconductor版本:发行版(3.16)

这个包是一个实现的聚类集成方法MoSBi(分子签名识别从聚类)。MoSBi为聚类结果提供了标准化接口，并可以将其结果与多算法集成方法结合起来，在分子组学数据上计算稳健的集成聚类。这是通过计算双簇的相似网络和使用自定义错误模型过滤重叠来完成的。在此基础上，利用鲁汶模块性从相似网络中提取双簇群落，并将其转化为集成双簇。此外，MoSBi还包括一些网络可视化方法，以提供直观和可扩展的结果概述。MoSBi附带了几个聚类算法，但可以很容易地扩展到新的聚类算法。

作者:Tim Daniel Rose [cre, aut]， Josch Konstantin Pauling [aut]， Nikolai Koehler [aut]

维护者:Tim Daniel Rose < Tim。罗斯在wzw.tum.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mosbi”)

超文本标记语言	R脚本	样例流程
超文本标记语言	R脚本	similarity-metrics-evaluation
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，网络，软件，StatisticalMethod
版本	1.4.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	AGPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 4.1)
进口	Rcpp，黑洞，xml2、方法、igraph，fabia。，RcppParallel，biclust，isa2，QUBIC，akmbiclust，RColorBrewer
链接	Rcpp，黑洞，RcppParallel
建议	knitr，rmarkdown，BiocGenerics，runibic，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements	c++ 17, GNU制作
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	mosbi_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	mosbi_1.4.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	mosbi_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	mosbi_1.4.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosbi
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosbi
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mosbi/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mosbi/
软件包下载报告	下载数据