ompBAM

DOI:10.18129 / B9.bioc.ompBAM

基于openmp的多线程顺序分析二进制对齐映射(BAM)文件的c++库

Bioconductor版本:发行版(3.15)

这个包为希望创建处理BAM文件的R包的开发人员提供了c++头文件。2021欧洲杯体育投注开户ompBAM自动化了文件访问、内存管理和“幕后”多线程处理，因此开发人员可以专注于创建特定领域的功能。2021欧洲杯体育投注开户附带的小插图包含该API的详细文档，包括创建新的基于ompam的包的快速入门说明，以及ompam中包含的示例包背后的功能的逐步解释。

作者:Alex Chit Hei Wong [aut, cre, cph]

维护者:Alex Chit Hei Wong

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ompBAM")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ompBAM”)

超文本标记语言	R脚本	ompBAM API文档
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	对齐，DataImport，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	跑龙套,Rcpp，zlibbioc
链接
建议	RcppProgress，knitr，rmarkdown，roxygen2，devtools，usethis，desc，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/alexchwong/ompBAM
BugReports	https://support.bioconductor.org/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ompBAM_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	ompBAM_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ompBAM_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ompBAM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ompBAM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ompBAM/
包下载报告	下载数据