pcxn

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcxn

探索、分析和可视化功能利用pcxnData包

Bioconductor版本:版本(3.17)

发现相关通路/基因组一个通路/设置或发现多个通路/基因集之间的相关关系。画一个热图或者创建一个网络查询和提取每个通路/基因集的成员中找到可用的集合(MSigDB H标志,MSigDB C2规范途径,MSigDB C5 BP和Pathprint)。

作者:Sokratis Kariotis,要是Pita-Juarez,温斯顿隐藏,Wenbin魏

维护人员:Sokratis Kariotis < s。在sheffield.ac.uk kariotis >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pcxn”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pcxn”)

PDF	R脚本	pcxn
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ExperimentData,ExpressionData,地理,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,OneChannelData,PathwayInteractionDatabase,软件
版本	2.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4),pcxnData
进口	方法、grDevices pheatmap跑龙套
链接
建议	igraph,注释,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	pcxnData
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	pcxn_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	pcxn_2.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	pcxn_2.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	pcxn_2.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcxn
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pcxn
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/pcxn/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pcxn/
包下载报告	下载数据