plgem

DOI:10.18129 / B9.bioc.plgem

利用幂律全球误差模型(PLGEM)检测微阵列和蛋白质组学数据集中的差异表达

Bioconductor版本:发行版(3.16)

幂律全球误差模型(PLGEM)已被证明可以忠实地模拟存在于各种全基因组数据集中的方差-均值依赖性，包括微阵列和蛋白质组学数据。PLGEM的使用已被证明可以提高这些数据集中差异表达基因或蛋白质的检测。

作者:Mattia Pelizzola < Mattia。pelizzola在gmail.com>和Norman Pavelka

维护者:Norman Pavelka

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“plgem”)

PDF	R脚本	PLGEM的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，MassSpectrometry，微阵列，蛋白质组学，软件
版本	1.70.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)
进口	跑龙套,Biobase(> = 2.5.5),质量、方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.genopolis.it
全靠我
进口我	检查
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	plgem_1.70.0.tar.gz
Windows二进制	plgem_1.70.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	plgem_1.70.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	plgem_1.70.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plgem
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/plgem
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/plgem/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/plgem/
软件包下载报告	下载数据