qmtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.qmtools

定量代谢组学数据处理工具

Bioconductor版本:发行版(3.15)

qmtools(定量代谢组学工具)包提供了使用标准summarizeexperiment类处理定量代谢组学数据的基本工具。这包括一些功能，如:归一化、特征过滤、特征聚类、降维和可视化，以帮助用户为统计分析准备数据。这个包中的几个函数也可以用于其他类型的组学数据。

作者:Jaehyun Joo [aut, cre]， Blanca Himes [aut]

维护者:Jaehyun Joo

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("qmtools")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qmtools”)

超文本标记语言	R脚本	定量代谢组学数据处理
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，MassSpectrometry，代谢组学，归一化，预处理，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)，SummarizedExperiment
进口	rlang，ggplot2，拼接而成，的热图、方法、MsCoreUtils统计数据,igraph，VIM，尺度， grDevices，图形
链接
建议	limma，Rtsne，missForest，vsn，pcaMethods，请，MsFeatures，嫁祸于，imputeLCMD，nlme，testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/HimesGroup/qmtools
BugReports	https://github.com/HimesGroup/qmtools/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qmtools_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	qmtools_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	qmtools_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qmtools
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qmtools
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qmtools/
软件包下载报告	下载数据