qsvaR

DOI:10.18129 / B9.bioc.qsvaR

生成退化修正的质量替代变量分析

Bioconductor版本:发行版(3.15)

qsvaR包包含从死后脑组织的rna-seq数据中去除降解影响的功能。该软件包的配置是为了帮助用户生成与降级相关的主组件。该组分可用于差异表达分析，以消除降解的影响。

作者:Joshua Stolz [aut, cre]，莱昂纳多·科拉多-托雷斯[ctb]

维护者:Joshua Stolz

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("qsvaR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qsvaR”)

超文本标记语言	R脚本	qsvaR介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，报道，DifferentialExpression，归一化，测序，软件，WorkflowStep
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.2)，SummarizedExperiment
进口	股东价值分析统计数据,ggplot2、方法
链接
建议	BiocFileCache，BiocStyle，covr，knitr，limma，RefManageR，rmarkdown，sessioninfo，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/qsvaR
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/qsvaR
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qsvaR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	qsvaR_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	qsvaR_1.0.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/qsvaR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qsvaR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qsvaR/
软件包下载报告	下载数据