randRotation

DOI:10.18129 / B9.bioc.randRotation

随机旋转与批处理高维数据结构的方法

Bioconductor版本:版本(3.17)

一组方法来执行随机旋转高维、正态分布的数据(如微阵列或RNA-seq数据)与批处理结构。随机旋转方法允许精确的测试相关的测试统计线性模型在任意批量效应校正方法。

作者:彼得Hettegger (aut (cre)

维护人员:彼得Hettegger < p。在gmail.com hettegger >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“randRotation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	随机旋转方案介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,MicroRNAArray,微阵列,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	方法、图形跑龙套,统计,Rdpack (> = 0.7)
链接
建议	knitr,BiocParallel,nlme lme4 rmarkdown,BiocStyletestthat(> =魅惑,limma,股东价值分析
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/phettegger/randRotation
BugReports	https://github.com/phettegger/randRotation/issues
取决于我
进口我
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我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	randRotation_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	randRotation_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	randRotation_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/randRotation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ randRotation
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/randRotation/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/randRotation/
包下载报告	下载数据