rawrr

DOI:10.18129 / B9.bioc.rawrr

直接访问Orbitrap数据和超越

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包包装RawFileReader net程序集的功能。在R环境、光谱和色谱图由S3对象(Kockmann t . et al。(2020) )。包提供了基本功能,下载和安装所需的第三方库。包的开发,测试,和使用功能基因组学中心苏黎世瑞士 。

作者:基督教Panse (aut (cre),托拜厄斯Kockmann (aut)

维护人员:基督教Panse < cp在fgcz.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rawrr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rawrr”)

HTML	R脚本	直接访问Orbitrap数据和超越
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文本		安装

细节

biocViews	MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1)
进口	grDevices、图形数据,跑龙套
链接
建议	BiocStyle(> = 2.5),ExperimentHub,knitr,protViz(> = 0.7),rmarkdown,鞑靼(> = 1.5),testthat
SystemRequirements	mono-runtime 4。x或更高版本(包括系统。数据库)在Linux / macOS、。net框架(> = 4.5.1)在使用微软的Windows操作系统。
增强了
URL	https://github.com/fgcz/rawrr/
BugReports	https://github.com/fgcz/rawrr/issues
取决于我
进口我	MsBackendRawFileReader
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	rawrr_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	rawrr_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rawrr_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rawrr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rawrr
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rawrr/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rawrr/
包下载报告	下载数据