ACME

DOI:10.18129 / B9.bioc.ACME

计算微阵列富集(ACME)算法

Bioconductor版本:Release (3.15)

ACME(算法计算微阵列富集)是一套工具，用于分析平片阵列ChIP/ ChIP, DNAse超敏反应，或其他导致基因组区域显示“富集”的实验。它不依赖于特定的阵列技术(尽管阵列应该是一个“平铺”阵列)，非常通用(可以应用于导致富集区域的实验)，并且对阵列噪声或归一化方法非常不敏感。它的运算速度非常快，在有足够内存的情况下，可以很容易地应用于全基因组平铺阵列实验。

作者:Sean Davis

维护者:Sean Davis

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“极致”)

PDF	R脚本	ACME
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.52.0
在Bioconductor	BioC 2.0 (R-2.5)(15年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.10)，Biobase(>= 2.5.5)，方法BiocGenerics
进口	图形、统计数据
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
全靠我
进口我
建议我	益生元
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	ACME_2.52.0.tar.gz
Windows二进制	ACME_2.52.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	ACME_2.52.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACME
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ACME
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ACME/
软件包下载报告	下载数据