ancombc

doi：10.18129/b9.bioc.ancombc

分析具有偏置校正的微生物组的组成

生物导体版本：版本（3.15）

ANCOMBC是一个包含差异丰度（DA）的软件包和微生物组数据的相关分析。具体而言，该软件包包括分析具有偏置校正（ANCOM-BC）的微生物组的组成以及用于DA分析的微生物组（ANCOM）组成的分析，以及用于相关分析的微生物组（SECOM）之间相关性（SECOM）之间相关性的稀疏估计。微生物组数据通常受到两个偏见来源：不等的采样部分（样本特定偏见）和差分测序效率（分类群特定的偏见）。ANCOMBC软件包中包含的方法旨在纠正这些偏差并构建统计上一致的估计器。

作者：Huang Lin [CRE，AUT]

维护者：lin

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ ancombc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ancombc”）

html	R脚本	ancombc
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.2
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看
进口	马格里特，，，，rdpack，，，，rlang，，，，微生物组，，，，门索，统计desctools，，，，HMISC，，，，大量的，，，，多帕尔，，，，Dorng，，，，dplyr，，，，活力，，，，foreach，，，，nlme，，，，nloptr， 平行，蒂布尔，，，，花花公子
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，DT，，，，Corrplot，，，，GGFORCE，，，，林玛，，，，qwraps2（> = 0.5.0），平淡无奇
系统要求
增强
URL	https://github.com/frederickhuanglin/ancombc
BugReports	https://github.com/frederickhuanglin/ancombc/issues
取决于我
进口我	微生物膜标志物
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ancombc_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	ancombc_1.6.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ancombc_1.6.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ancombc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ancombc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ancombc/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档