- 家
- Biocumon 3.13
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- Apalyzer.
Apalyzer.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.apalyzer.
使用RNA-SEQ数据的APA分析工具包
Bioconductor版本：释放（3.13）
使用RNA-SEQ数据执行3'UTR APA，内肠病APA和基因表达分析。
作者：瑞嘉王[CRE，AUT]
，宾田[aut]，楚伟忠[aut]
维护者：Ruijia Wang
引文（从R内，输入引文（“Apalyzer”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“Apalyzer”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“APALYZER”）
| HTML. | r script. | Apalyzer：RNA-SEQ APA分析的工具包 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 依靠 | r（> = 3.5.0） |
| 进口 | Genomicranges.那基因组法那基因管理那deseq2.那GGRepel.那概括分析那rsubread.，统计，ggplot2.， 方法，rtracklayer.那Ensembldb.那VariantAnnotation.那dplyr.那Tidyr.那repmis.那RSAMTOOLS. |
| 链接到 | |
| 建议 | kn那RAMAMAMDOW.那生物焦那org.mm.eg.db.那annotationdbi.那tbx20bamsubset.那testthat.那Pasillabamsubset. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/rjwangbioinfo/apalyzer/ |
| Bugreports. | https://github.com/rjwangbioinfo/apalyzer / issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | apalyzer_1.6.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | apalyzer_1.6.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | apalyzer_1.6.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/apalyzer. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包裹/ apalyzer |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/apalyzer/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
