分配

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASSIGN

自适应签名选择与集成(ASSIGN)

Bioconductor版本:发行版(3.12)

ASSIGN是一种计算工具,用于评估个体患者样本中的通路解除管制/激活状态。ASSIGN采用了一种灵活的贝叶斯因子分析方法,该方法适应从基于知识的文献或从扰动实验中获得的预定通路签名到细胞/组织特异性通路签名。每个上下文特定通路的解除管制/激活水平被量化为分数,这表示患者样本包含通路解除管制/激活签名的程度。

作者:沈莹,安德里亚·h·比尔德,w·埃文·约翰逊,穆特赫娜·拉赫曼

维护者:沈莹, W. Evan Johnson , David Jenkins , Mumtehena Rahman

引文(从R内,输入引用(“转让”)):

安装

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如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R (>= 3.4)
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URL https://compbiomed.github.io/ASSIGN/
BugReports https://github.com/compbiomed/ASSIGN/issues
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源包 ASSIGN_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 ASSIGN_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ASSIGN_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASSIGN
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASSIGN
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ASSIGN/
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