Aneufinder

doi：10.18129/b9.bioc.aneufinder

分析单细胞序列数据中的拷贝数变化

生物导体版本：版本（3.13）

Aneufinder在单细胞整体基因组测序和链序列数据中实现了用于拷贝数检测，断点检测以及核型和异质性分析的功能。

作者：Aaron Taudt，Bjorn Bakker，David Porubsky

维护者：aaron taudt

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ aneufinder”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Aneufinder”）

PDF	R脚本	快速介绍Aneufinder
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.5），基因组机，，，，GGPLOT2，，，，牛仔图，，，，Aneufinderdata
进口	方法，UTILS，GRDEVICES，图形，统计信息，foreach，，，，多帕尔，，，，生物基因（> = 0.31.6），S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，rsamtools，，，，bamsignals，，，，DNACOPIGY，，，，ECP，，，，生物弦，，，，基因组签名，，，，RESHAPE2，，，，ggdendro，，，，Ggrepel，，，，重新排序，，，，mclust
链接
建议	尼特，，，，生物使用，，，，测试，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10
系统要求
增强
URL	https://github.com/ataudt/aneufinder.git
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Aneufinder_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	aneufinder_1.20.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Aneufinder_1.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aneufinder
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/aneufinder
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/aneufinder/
软件包下载报告	下载统计