AnnotationForge

DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationForge

用于构建基于sqlite的注释数据包的工具

生物导体版本:发布(3.13)

提供用于生成注释包及其数据库的代码。生成的包旨在与AnnotationDbi一起使用。

作者:马克·卡尔森，Hervé Pagès

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install(“AnnotationForge”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AnnotationForge”)

PDF	R脚本	AnnotationForge:为自定义注释资源创建选择接口
PDF	R脚本	创建探测包
超文本标记语言	R脚本	制作新的有机体包装
PDF	R脚本	SQLForge:一种使用标准数据库模式创建新的注释包的简单方法。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.5.0)，方法，utils，BiocGenerics(> = 0.15.10),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.33.14)
进口	DBI，RSQLite，XML，S4Vectors，RCurl
链接
建议	biomaRt，httr，GenomeInfoDb(> = 1.17.1),Biostrings，affy，hgu95av2.db，human.db0，org.Hs.eg.db，Homo.sapiens，GO.db，减价，BiocStyle，knitr，BiocManager，BiocFileCache
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/AnnotationForge
BugReports	https://github.com/Bioconductor/AnnotationForge/issues
取决于我
进口我	AnnotationHubData，GGHumanMethCancerPanelv1.db，GOstats，ViSEAGO
建议我	AnnotationDbi，AnnotationHub
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	AnnotationForge_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	AnnotationForge_1.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	AnnotationForge_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationForge
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AnnotationForge
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/AnnotationForge/
包下载报告	下载数据