AssessORF

DOI:10.18129 / B9.bioc.AssessORF

利用蛋白质组学和进化保守评估基因预测

Bioconductor版本:发行版(3.13)

为了评估一个基因组的一组预测基因的质量，必须首先将证据映射到该基因组。接下来，每个基因必须根据支持或反对该基因的证据的强弱进行分类。AssessORF包提供完成这些任务所需的函数和类结构，使用蛋白质组命中和进化保守的开始密码子作为证据形式。

作者:Deepank Korandla [aut, cre]， Erik Wright [aut]

维护者:Deepank Korandla

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“AssessORF”)

PDF	R脚本	使用AssessORF
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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),解读(> = 2.10.0)
进口	Biostrings，GenomicRanges，IRanges，图形，grDevices，方法，统计，utils
链接
建议	AssessORFData，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	AssessORFData
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	AssessORF_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	AssessORF_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	AssessORF_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AssessORF
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AssessORF
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/AssessORF/
包下载报告	下载数据