Bbcanalyzer.

DOI:10.18129 / b9.bioc.bbcanalyzer.

BBCanalyzer:用于可视化基数的R / Biocuconductor包

Bioconductor版本:释放(3.13)

BBCanalyZer是用于可视化作为BAM文件的序列对齐数据的定义位置的相对或绝对数量的基础,删除和插入的包装,与参考基础相比。相对基础频率的标记,检测到的碱基的平均质量,已知的突变或多态性和在数据中称为数据的变体可以包括在图中。

作者:莎拉桑曼

维护者:萨拉桑德曼

引文(从R内,输入引文(“bbcanalyzer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“bbcanalyzer”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“BBCANALYZER”)

PDF. r script. 使用bbcanalyzer.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.22.0
在生物导体中以来 BIOC 3.2(R-3.2)(5.5岁)
执照 LGPL-3
依靠
进口 概括分析VariantAnnotation.RSAMTOOLS.,grdevices,Genomicranges.绞喉生物仪器
链接到
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 bbcanalyzer_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件 bbcanalyzer_1.22.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) bbcanalyzer_1.22.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/bbcanalyzer.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ bbcanalyzer
包短网址 https://biocumon.org/packages/bbcanalyzer/
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