BDMMACORCT

doi：10.18129/b9.bioc.bdmmacorect

元基因组读数计数来自不同队列的数据的荟萃分析

生物导体版本：版本（3.15）

宏基因组测序技术可以对微生物组进行定量分析。但是，由于实验之间的变化，将这些实验中的微生物数据组合起来是具有挑战性的。校正批处理效应的现有方法没有考虑变量之间的相互作用（微生物研究中的菌群分类单元）和微生物组数据的过度分散。因此，它们不适用于微生物组数据。我们开发了一种新方法，即贝叶斯迪里奇 - 灌注回归荟萃分析（BDMMA），以同时对批处理效应进行建模并检测与表型相关的微生物类群。BDMMA会自动建模微生物分类单元之间的依赖性，并且对微生物组及其关联稀疏性的高维度具有鲁棒性。

作者：zhenwei dai

维护者：zhenwei dai

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ BDMMACORCT”）

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ bdmmacorect”）

PDF	R脚本	BDMMACORRECT_USER_GUIDE
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.5），素食主义者，，，，椭圆，，，，GGPLOT2，，，，猿，，，，总结性特征
进口	RCPP（> = 0.12.12），rcpparmadillo，，，，rcppeigen，统计
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo，，，，rcppeigen
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	bdmmacorrect_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	bdmmAcorrect_1.14.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	bdmmacorrect_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bdmmacorect
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/bdmmacorect
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/bdmmacorrect/
软件包下载报告	下载统计