BUScorrect

DOI:10.18129 / B9.bioc.BUScorrect

带有未知子类型的批处理效果校正

Bioconductor版本:发行版(3.16)

高通量实验数据在公共数据库中呈指数级积累。然而，从这些丰富的资源中挖掘有效的科学发现受到技术人工制品和固有的生物异质性的阻碍。前者通常被称为“批处理效应”，后者通常用“子类型”来建模。R包BUScorrect符合贝叶斯层次模型，即带有未知子类型的批处理效果校正模型(BUS)，以纠正存在未知子类型的批处理效果。BUS能够(a)显式更正批处理效应，(b)将具有相似特征的样本分组为子类型，(c)识别区分子类型的特征，(d)享受线性顺序的计算复杂度。

作者:罗翔宇，韦莹莹

维护人员:Xiangyu Luo

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BUScorrect")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“BUScorrect”)

PDF	R脚本	BUScorrect_user_guide
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.16.0
在Bioconductor公司	BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	gplots，方法，grDevices，统计，SummarizedExperiment
链接
建议	BiocStyle，knitr，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BUScorrect_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	BUScorrect_1.16.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	BUScorrect_1.16.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BUScorrect_1.16.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/BUScorrect
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BUScorrect
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BUScorrect/
软件包下载报告	下载数据